缘起
G显带染色体核型分析技术是细胞遗传学检测染色体非整倍体、多倍体、平衡和非平衡性结构重排、较大片段的微缺失/微重复以及嵌合体的“金标准”，但该技术具有细胞培养耗时长、分辨率低以及耗费人力的局限性。包括荧光原位杂交（Fluorescence in Situ Hybridization， FISH）、荧光定量聚合酶链式反应（Polymerase Chain Reaction，PCR）和多重连接探针扩增（Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification，MLPA）技术在内的快速产前诊断技术的引入虽然具有快速及特异性高的优点，但还不能做到对染色体组的全局分析。
在西方国家，联合应用超声、核型分析以及微阵列技术已对识别妊娠期胎儿染色体异常、诠释习惯性流产以及诊断儿童和成人未知生理和心理问题产生重大影响，可为提高其生活质量提供更好的治疗方案。但在发展中国家和一些发达国家，微阵列技术因技术难度高、缺少专业知识和高成本等原因尚未得到广泛运用，故而新生儿染色体疾病发病率仍很高。目前，临床上亟需微阵列技术的替代方法，以便全面准确、经济实惠地检测大多数染色体疾病。研究发现，基于高通量测序技术（Next Generation Sequencing，NGS）的染色体拷贝数变异检测（CNV-seq）技术有望满足这一需求。
探索
2013年初，中南大学湘雅医院与北京贝瑞和康生物技术股份有限公司（以下简称“贝瑞和康”）合作，对收集的72例临床样本进行CNV-seq回顾性临床研究，研究采用双盲试验设计，并将CNV-seq检测结果与SNP Array结果进行比对。结果显示，CNV-seq和SNP Array对于已知致病CNVs都能达到100%的检出，但在对于某些小于1Mb致病性未知的CNVs检测上，CNV-seq则明显优于SNP Array。以上结果说明CNV-seq相比SNP Array更能发现新的染色体疾病，进而更深入的阐释胎儿异常、流产、不孕不育以及先证者患病的原因。该结果于2014年发表于《Journal of Molecular Diagnostics》【1】。
发展
2014年，南方医科大学南方医院与贝瑞和康合作，比较了传统核型分析G显带技术与CNV-Seq在检测与自发流产相关的染色体异常方面的效能。研究结果表明，CNV-Seq与STR分析同时运用，可作为核型分析的替代技术，用于检测与自发流产相关的染色体拷贝数异常，检测结果可靠且准确。该结果于2015年发表于《Ultrasound Obstet Gynecol》【2】。
2015年，南京大学医学院附属鼓楼医院与贝瑞和康合作，联合运用CNV-seq和SNP-array技术对115例产前超声结构异常的羊水样本进行检测，并随机选择了38例进行了双盲平行对照。结果显示，除一个样本背景信号高未检出结果外，其余37例样本阳性符合率100%，阴性符合率100%。结论是CNV-seq可以替代高密度微阵列芯片用于产前超声结构异常的染色体异常检测。该结果于2016年发表于《Journal of Molecular Diagnostics》【3】。
成熟
近年来，CNV-seq技术在染色体结构变异检测中的应用越来越广泛，很多研究也证明了该技术具有传统染色体核型分析方法所无法比拟的优势。CNV-seq技术对染色体非整倍体和不平衡性重排的检出效率与传统核型分析方法相同，并具有更高的分辨率和敏感性，且CNV-seq还能发现更多的、有临床意义的基因组CNV，尤其是对于产前超声发现胎儿结构异常者，CNV-seq是目前最有效的遗传学诊断方法之一。
目前，贝瑞和康已与国内超过300家医院合作开展CNV-seq项目，且陆续有大型产前诊断中心全环节自主开展。CNV-seq尤其适用于以下几类临床应用情况
参考文献
1.Liang D, Peng Y, Lv W, et al. Copy number variation sequencing for comprehensive diagnosis of chromosome disease syndromes.[J]. Journal of Molecular Diagnostics Jmd, 2014, 16(5):519-26.
2. Liu S, Song L, Cram D S, et al. Traditional karyotyping versus copy number variation sequencing for detection of chromosomal abnormalities associated with spontaneous miscarriage[J]. Ultrasound in Obstetrics and Gynecology, 2015, 46(4):3665-3674.
3. Zhu X, Li J, Ru T, et al. Identification of copy number variations associated with congenital heart disease by chromosomal microarray analysis and next generation sequencing.[J]. Prenatal Diagnosis, 2016, 36(4):321–327.