短串联重复序列(short tandem repeat, STR)是核心序列为2-6个碱基的短串联重复结构。20世纪90年代初,STR基因座首次作为一种重要的遗传标记在人类亲权鉴定中被使用(Edwards et al.,1992;Edwards et al.1991)。
STR分型检测(short tandem repeat)是一种检测技术。主要用于检测人类及哺乳动物的基因组。
STR(short tandem repeat,短片段重复序列)广泛存在于人类及哺乳动物的基因组中,具有高度多态性,它们一般由2-6个碱基构成一个核心序列,核心序列串联重复排列,由核心序列重复数目的变化产生长度多态性。对于一个特定的个体,染色体上某个特定位置的重复序列的重复次数是固定的,而对于不同的个体在同一位置处的重复次数可能不同,这就构成了人群中这些重复序列的多态性。由于人类基因组中这种重复序列非常多,通过对这种多态性的检测,就可以明确区分个体与个体的不同,确定父母子的亲缘关系。
由于STR技术的高灵敏度、自动化程度高、准确快速、重复性好等优点,STR基因分型已被作为金标准应用于细胞鉴定,由于细胞系交叉污染或错误辨识而导致研究错误、结果不可重复等情况的存在,因此建议在实验开展前进行细胞的STR鉴定分析。
细胞STR鉴定即通过STR信息建立细胞系的遗传特性,通过STR鉴定来检测细胞是否发生交叉污染或者误认的情况。STR 基因座位上的等位基因可通过扩增区域内重复序列拷贝数的不同来区分,在毛细管电泳分离之后可通过荧光检测来识别。随后通过一定的计算方法,即可根据所得的STR分型结果与细胞STR数据库比对,从而推算出样品所属的细胞系或可能的交叉污染的细胞系名称。